Masako Honda werd geboren in Japan waar ze afstudeerde als licentiate in de West-Europese geschiedenis. In België behaalde zij het meesterdiploma orgel bij Joris Verdin aan het Koninklijk Vlaams Muziekconservatorium te Antwerpen. Op het historisch koororgel van de Sint-Niklaaskerk in Neerpelt brengt Masako Duitse en Vlaamse muziek, met werk van Bach, Buxtehude, Krebs, Van den Kerckhoven, Vander Borght, Van Ingelgem.